2007/4/19

介紹 HubMed



http://www.hubmed.org/
Medline 資料庫沒有同仁不知道,你可能喜歡用 NLM 的 pubmed,也可能較熟悉 OVID 的 Medline@Ovid. 不過,你大概很少或者根本沒聽過 hubmed.

hubmed 是利用 NCBI 的 EUtils 網頁服務,將 pubmed 的資料用另一種方式詮釋。hubmed 和 pubmed 使用相同的檢索語法,而用相同的語法檢索 pubmed 和 hubmed 將得到相同的結果,但 pubmed 和 hubmed 的表現方式就截然不同。


hubmed 有以下幾個特點:
  1. hubmed 找到的資料可以按資料的日期 (date) 或關連性 (relevance) 排序。(註:這個 relevance 並不像 Google Scholar 是以被引用的次數排名。)
  2. hubmed 找到的資料可以轉換成 rss feed 的方式,供使用者訂閱。若有更新,你的 rss reader 就可以即時讀到新的資料,方便追蹤和閱讀。雖然,pubmed (My NCBI) 和 Medline@Ovid 都有提供 email alert 的功能,也就是依你設定的檢索策略找到新文章時,會定期寄新的書目給你。不過,個人認為 rss feed 的方式還有其他很多好處,值得大家試一試。
  3. 網頁的顯示充分利用 AJAX 和 java 的特性。網頁的資料可以自由展開 (expand) 和收縮 (collapse)。在檢索時,利用 expand search term 及 AND/OR,點幾個滑鼠按鍵,就可以使用第一次結果中出現頻率最高的關鍵字進行更複雜的檢索。另外,可以再依次主題的相關性將文章進行分類 (cluster) 或是顯示 MeSH 的相關資訊。
  4. 找到的書目資料,也可以輸出給 endnote 或是其他文獻書目管理軟體。HubMed's import filter for Endnote (解開後複製到 Filters 的目錄中)。
  5. 利用 clip 可將文獻登記到 clipboard 中。或是利用人工建立 tag 管理並分類你收集的書目。
  6. 書目可以選擇顯示摘要 (abstract) 或是摘錄 (extract)。
  7. 選擇顯示摘要時:
    • 在全文部分提供 SFX 及 Google Scholar 的連結。
    • 而 Cites 會顯示引用該文章的書目,這部分是使用 PubMed Central,Google Scholar 和 Scopus 的資料。有點像 SCI (Web of Science),不過是免費的,但資料就不是那麼齊全。
    • Related 可用於找出相關文章。而 Graph 就是利用獨門 touch graph 來觀察各個關鍵字間的關連性。看到這個圖,都足以使任何電腦怪客興奮一陣子,不過,實用性如何還有待觀察。
  8. 其他還有一些進階功能,如:Rank Relations, Citation Finder, Firefox Bookmarklet/Extension。有趣興的可以自己試試,再和大家分享。

這個網站已上線多年,目前我最常用的就是將各式各樣的資料轉會 rss feed 方便自己訂閱及追蹤。特別是一些沒有電子目錄服務的期刊。之後就為大家一一介紹。